Transposon sequencing: A powerful tool for the functional genomic study of food-borne

撰写单位：浙江大学

浙江大学团队在国际知名学术期刊《Trends in Food Science and Technology》发表题为“Transposon sequencing: A powerful tool for the functional genomic study of food-borne”（转座子测序：食源性病原体功能基因组研究的强大工具）。

该文章介绍了一种新兴的微生物功能基因组学技术——转座子测序（Tn-seq）。该技术基于转座子诱变和高通量测序技术，能够在单次实验中定量跟踪数百万个独立突变体，从而高效地绘制细菌的“基因型-表型”关系和遗传相互作用网络。这种技术可以为食源性病原体的生理、致病机制和环境存活等方面提供全面的认识。食源性病原体是指通过食物或饮用水传播的病原体。这些病原体可能导致轻微到严重的健康问题，包括腹泻、呕吐、发热等。通过Tn-seq技术，我们可以更好地了解这些病原体在恶劣环境下存活和致病的机制，从而为预防和治疗提供更好的方法。虽然传统方法如物理诱变、化学诱变和标记DNA片段插入突变技术等可以进行基因组范围内的功能遗传学研究，但它们耗时、费力且精度低。而RNA-Seq等组学方法虽然能够进行基因组范围内的高通量研究，但所得到的基因转录或表达结果不能建立遗传决定因素与特定功能之间的直接因果关系。相比之下，Tn-seq技术具有更高效、更精确、更全面地揭示细菌功能基因组学特征等优点。

https://doi.org/10.1016/j.tifs.2021.06.032