Whole genome sequencing for the risk assessment of probiotic lactic acid bacteria

撰写单位：浙江大学

浙江大学团队在国际知名学术期刊《Critical Reviews in Food Science and Nutrition》发表题为“Whole genome sequencing for the risk assessment of probiotic lactic acid bacteria”综述文章（全基因组测序用于益生乳酸菌的风险评估）。

益生菌对人类和动物健康表现出有益的作用，几十年来已广泛应用于食品和发酵产品中。大多数益生菌由乳酸菌组成，乳酸菌已被用于各种食品的生产，但也被证明具有预防某些疾病的功能。随着乳酸菌应用的扩大，人们对其安全性的关注日益增加，因为它可能会引起人和动物的严重感染、抗菌素耐药基因转移等负面结果。目前，体外试验仍然是评估乳酸菌安全性的主要方法。然而，在食品安全概念不断发展的背景下，此类方法无法满足高通量规模菌株风险评估的需求。分析乳酸菌完整的遗传信息（包括潜在的毒力基因和其他对动物健康产生负面影响的决定因素）可以评估乳酸菌产品使用的安全性。因此，可以对单个乳酸菌菌株进行全基因组测序。基因组数据还可用于了解菌株水平的细微差异，这对于了解其益生效果及专利保护至关重要。我们认为，基于全基因组测序的生物信息学分析是一种理想且经济的、用于初步风险评估的方法，同时该技术有助于增进我们对于乳酸菌在食品安全评估及益生特性方面的了解。

https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/10408398.2022.2087174